Investigación

Ácidos nucleicos en su contexto dinámico completo

El Dans Lab se enfoca principalmente en el estudio de la estructura y la dinámica de los ácidos nucleicos y sus interacciones con proteínas, ligandos pequeños y el solvente, desde una perspectiva molecular.

Usamos y desarrollamos campos de fuerzas all-atom y modelos coarse-grained para simulaciones atomísticas, nanoscópicas y mesoscópicas. También usamos y desarrollamos enfoques de Deep Learning para la predicción de estructuras 3D y herramientas bioinformáticas para la minería de datos en bases de datos estructurales especializadas.

Abordamos todos nuestros proyectos desde una perspectiva multiescala que busca conectar el mundo cuántico con el nivel macroscópico — desde los electrones hasta los cromosomas.

Genómica bacteriana y resistencia antimicrobiana

Una segunda línea principal del DansLab aborda la genómica y la biología molecular de la resistencia antimicrobiana, con foco en patógenos ESKAPE. Seguimos cómo evolucionan los aislamientos clínicos bajo antibióticos de último recurso y caracterizamos los determinantes genéticos y metabólicos detrás de la resistencia, el hetero-antagonismo y la aparición de variantes de colonia pequeña.

Combinando secuenciación completa de genoma, genómica comparativa, transcriptómica y modelado estructural, mapeamos la diseminación de carbapenemasas (NDM, KPC, OXA) en brotes hospitalarios de América Latina, diseccionamos mecanismos de resistencia espontánea in vitro y exploramos factores no canónicos. El objetivo es traducir esa información mecanística en herramientas concretas para la vigilancia clínica y en el diseño de terapias de próxima generación basadas en ASO, siRNA, aptámeros y oligoterapéuticos en general.

Líneas y proyectos actuales

16 proyectos en curso o recientemente activos, abarcando consorcios, co-direcciones de doctorado y maestría, y divulgación.