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ABC 2023

Ascona B-DNA Consortium · Workshop internacional

La conferencia ABC 2023 es un espacio para discutir las propiedades físicas del ADN dependientes de la secuencia, nuevos métodos y nuevos modelos, con una perspectiva multiescala. Desde la escala atomística más corta hasta escalas biológicamente más relevantes (mesoescala), es decir, desde los electrones hasta los nucleosomas.

Investigadores internacionales de primer nivel, miembros del ABC y colaboradores de diversos campos — experimentalistas, químicos/físicos computacionales y desarrolladores de nuevos métodos — convergen para discutir:

  • Desarrollo de campos de fuerzas all-atom para ácidos nucleicos
  • Propiedades mecánicas del ADN dependientes de secuencia
  • Modelos coarse-grained de ácidos nucleicos
  • Simulaciones multiescala de ácidos nucleicos
  • Interacciones proteína–ADN
  • Interacciones ADN–solvente
  • Estructura del nucleosoma y fibras de cromatina
  • Posicionamiento del nucleosoma
  • Modificaciones epigenéticas: ADN y colas de histonas

Historia del ABC

Fundado en 2001 durante el encuentro «Atomistic to Continuum Models for Long Molecules» en Ascona, Suiza, el Ascona B-DNA Consortium (ABC) reúne a grupos de dinámica molecular dedicados a establecer estándares para la simulación de ADN. Sus dos primeras fases sistemáticas (2004–2009) corrieron simulaciones de 15 ns sobre diez secuencias de 15 pares de bases con el campo de fuerzas parm94 y, con parmbsc0, llevaron a cabo el primer estudio exhaustivo de las 136 combinaciones únicas de tetranucleótidos.

En la década siguiente el consorcio llevó las escalas temporales al rango de los microsegundos con μABC (2010–2014), impulsando el desarrollo del campo de fuerzas parmbsc1, y el proyecto miniABC sobre 13 secuencias refinó las reglas de Calladine–Dickerson bajo distintas condiciones salinas. El esfuerzo actual, HexABC, reúne a 14 instituciones para caracterizar los 2080 hexanucleótidos únicos en escalas sub-milisegundo.

DansLab integra el ABC desde 2014, fue co-organizador del último encuentro (Ascona 2023) y co-organiza el próximo en Barcelona en 2027.

Comités científico y organizador

Científico

John Maddocks

John Maddocks

EPFL Lausanne CH

  • Wilma OlsonUS
  • Sarah HarrisUK
  • Modesto OrozcoSP
  • Tom CheathamUS
  • Lois PollackUS
  • Charles LaughtonUK

Organizador

Pablo D. Dans

Pablo D. Dans

UdelaR Salto UY

  • Agnes NoyUK
  • Alberto PérezUS
  • Daiva PetkeviciuteLT
  • Rodrigo Galindo-MurilloUS
  • Marco PasiFR
  • Rosana CollepardoUK
  • Federica BattistiniSP

Ganadores de la sesión de pósters

  • Kazi Amirul Hossain

    Role of Acidic Amino Acid Residues in Sequence-specific DNA-protein Interactions

    Kazi Amirul Hossain

    Gdańsk University of Technology

  • Victoria E. Hill

    DNA damage competes with sequence to pin a plectoneme

    Victoria E. Hill

    Department of Chemistry, The University of Sheffield

  • Maria Julia Maristany

    Mechanistic properties of DNA govern nucleosome unwrapping

    Maria Julia Maristany

    Department of Physics, University of Cambridge

Libro de resúmenes

Cronograma, participantes, programa científico y libro de resúmenes.

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Fotos

John Maddocks at ABC 2023 (1)
John Maddocks at ABC 2023 (2)
ABC 2023 conference moment (1)
ABC 2023 conference moment (2)
ABC 2023 conference moment (3)

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