La conferencia ABC 2023 es un espacio para discutir las propiedades físicas del ADN dependientes de la secuencia, nuevos métodos y nuevos modelos, con una perspectiva multiescala. Desde la escala atomística más corta hasta escalas biológicamente más relevantes (mesoescala), es decir, desde los electrones hasta los nucleosomas.
Investigadores internacionales de primer nivel, miembros del ABC y colaboradores de diversos campos — experimentalistas, químicos/físicos computacionales y desarrolladores de nuevos métodos — convergen para discutir:
- Desarrollo de campos de fuerzas all-atom para ácidos nucleicos
- Propiedades mecánicas del ADN dependientes de secuencia
- Modelos coarse-grained de ácidos nucleicos
- Simulaciones multiescala de ácidos nucleicos
- Interacciones proteína–ADN
- Interacciones ADN–solvente
- Estructura del nucleosoma y fibras de cromatina
- Posicionamiento del nucleosoma
- Modificaciones epigenéticas: ADN y colas de histonas
Historia del ABC
Fundado en 2001 durante el encuentro «Atomistic to Continuum Models for Long Molecules» en Ascona, Suiza, el Ascona B-DNA Consortium (ABC) reúne a grupos de dinámica molecular dedicados a establecer estándares para la simulación de ADN. Sus dos primeras fases sistemáticas (2004–2009) corrieron simulaciones de 15 ns sobre diez secuencias de 15 pares de bases con el campo de fuerzas parm94 y, con parmbsc0, llevaron a cabo el primer estudio exhaustivo de las 136 combinaciones únicas de tetranucleótidos.
En la década siguiente el consorcio llevó las escalas temporales al rango de los microsegundos con μABC (2010–2014), impulsando el desarrollo del campo de fuerzas parmbsc1, y el proyecto miniABC sobre 13 secuencias refinó las reglas de Calladine–Dickerson bajo distintas condiciones salinas. El esfuerzo actual, HexABC, reúne a 14 instituciones para caracterizar los 2080 hexanucleótidos únicos en escalas sub-milisegundo.
DansLab integra el ABC desde 2014, fue co-organizador del último encuentro (Ascona 2023) y co-organiza el próximo en Barcelona en 2027.
Comités científico y organizador
Científico

John Maddocks
EPFL Lausanne CH
- Wilma OlsonUS
- Sarah HarrisUK
- Modesto OrozcoSP
- Tom CheathamUS
- Lois PollackUS
- Charles LaughtonUK
Organizador

Pablo D. Dans
UdelaR Salto UY
- Agnes NoyUK
- Alberto PérezUS
- Daiva PetkeviciuteLT
- Rodrigo Galindo-MurilloUS
- Marco PasiFR
- Rosana CollepardoUK
- Federica BattistiniSP
Ganadores de la sesión de pósters

Role of Acidic Amino Acid Residues in Sequence-specific DNA-protein Interactions
Kazi Amirul Hossain
Gdańsk University of Technology

DNA damage competes with sequence to pin a plectoneme
Victoria E. Hill
Department of Chemistry, The University of Sheffield

Mechanistic properties of DNA govern nucleosome unwrapping
Maria Julia Maristany
Department of Physics, University of Cambridge
Libro de resúmenes
Cronograma, participantes, programa científico y libro de resúmenes.
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